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遗传在线发表上海交通大学秦胜营团队

发布时间:2021-5-3 5:45:50   点击数:

DOI:10./j.yczz.稿号20-

图3中国人群肝功能检测指标的曼哈顿图

肝功能检测(liverfunctiontest,LFTs)常用来评估肝功能和疾病,血液中高水平肝酶和胆红素与多种疾病相关,如黄疸,吉尔伯特综合征和多种伤害引起的肝损伤,包括酒精滥用,病毒感染,自身免疫,药物毒性和代谢综合征等。但同时,LFTs指标也是受遗传和环境影响的复杂性状,具有个体差异性。本研究利用英国生物银行(UKBiobank)中名中国人的基因分型数据和表型数据为研究对象,系统性研究中国人群全基因组范围内单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphism,SNP)与肝功能指标之间的联系。利用PLINK软件进行全关联分析研究(genome-wideassociationstudy,GWAS),发现个SNP与中国人群血液中的总胆红素(totalbilirubin,TB)相关,27个SNP与中国人群血液中碱性磷酸酶(alkalinephosphatase,ALP)相关,36个SNP与中国人群血液中的γ-谷氨酰转肽酶(γ-glutamyltranspeptidase,GGT)相关,1个SNP与中国人群血液中的门冬氨酸氨基转移酶(aspartatetransaminase,AST)相关,最显著的位点中有11个位点是新的LFTs关联位点。通过功能基因组分析,发现这些位点的临床意义(如吉尔伯特综合征),确定了候选基因(UGT1A,ABO,GGT1),为从遗传角度理解中国人群LFTs的个体差异性和肝功能指标临床精准检测提供了前期研究基础。

上海交通大学Bio-X研究院硕士研究生孙一丹为本文第一作者

中国知网网络首发和中国遗传网同时发布

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