激光治疗尖锐湿疣的整体复发率在60~70%，有些患者误以为只要一直做激光，打一次激光复发率就会小一些，其实不是的。激光治疗的原理是去除病变疣体，我们打个比方：类似发芽的土豆，我们把发出来的胚芽用刀割掉，不久后仍然会再次长出新的胚芽来。尖锐湿疣用激光治疗亦是如此，无论疣体打掉多少次，只要表皮细胞中还有HPV病毒感染，就很容易再次长出新的疣体，导致复发。
尖锐湿疣经过激光手术，外用药治疗后仍然有复发的可能。其原因可能是：
1、治疗不彻底，皮损韦能完全清除，亚临床感染的皮损持续存在。或者皮损的周围存在着潜伏感染。
2、局部伴发因素的存在，比如男性包皮过长，女性阴道炎或宫颈炎等。
3、患者全身或局部免疫状态低下，如HIV感染，妊娠，及有其他是免疫力低下的疾病。
4、再次感染，接触了患尖锐湿疣的新的性伴或者既往的性伴尖锐湿疣未彻底治愈的，都有可能引起复发。
激光作为尖锐湿疣比较常见的一种治疗方法，常用的是二氧化碳激光，烧灼疣体，一般1次即可使疣体脱落。但是。激光治疗尖锐湿疣副作用大，治疗后局部容易出现红肿、疼痛、烧灼感及溃疡形成。
而且据临床实践表明，激光治疗尖锐湿疣的复发率高达80%，多数患者的复发间隔多在1～3个月，间隔时间越长，越可能不再复发，复发间隔越短，越有可能反复复发。
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